報告題目:基于深度學習的空間轉錄組注釋方法SPANN
主講人:鄧明華教授(北京大學)
時間:2024年7月12日(周五)16:30 p.m.
地點:北院卓遠樓305會議室
主辦單位:統計與數學學院
摘要:本報告將介紹課題組最近開發的空間轉錄組注釋方法SPANN。SPANN的主要任務是將細胞類型標簽從注釋良好的scRNA-seq數據轉移到新生成的單細胞分辨率的空間轉錄組數據,并從空間數據中發現新的細胞。 SPANN利用最優傳輸理論,實現了空間轉錄組樣本和 RNA 數據原型之間的對齊,從而進行細胞類型級別的比對。
主講人簡介:
鄧明華,北京大學數學科學學院教授,現任中國商業統計學會副會長,中國工業與應用數學學會數學建模專委會副主任,中國現場統計研究會統計交叉分會副理事長。鄧明華1987年9月-1998年1月在北京大學數學學院學習,畢業后留校工作至今。2003年8月晉升為副教授,2006年任博士生導師,2009年8月晉升為教授。其間2001年2月-2003年8月在美國南加州大學計算分子生物學中心從事博士后研究,2009年8月-2010年1月美國耶魯大學訪問副教授。鄧明華從事生物信息學研究,發表SCI論文100余篇。曾先后主持5項自然科學基金面上項目和1項863項目,先后參加3項973項目和2項科技部重點研發項目。